WYKONANIE USŁUG BADAWCZYCH ORAZ EKSPERTYZ NIEZBĘDNYCH DO PRAWIDŁOWEJ REALIZACJI PROJEKTU MULTIGENBANK

Publication date	2015-10-05
End date	2015-10-13 10:00:00
Instytucja	Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polska Akademia Nauk
Miejscowość	Wrocław
Województwo	dolnośląskie
Branża	Usługi analizy systemu i programowania
Szczegóły
Numer ogłoszenia	262312 / 2015
Document type	ZP-400
Cpv code	722400009, 731000003
Adres strony internetowej siwz	http://www.iitd.pan.wroc.pl
BZP	Zobacz

Przedmiot zamówienia

Przedmiotem zamówienia jest wykonanie usług badawczych oraz ekspertyz niezbędnych do prawidłowej realizacji projektu, w ramach przygotowania i konwersji danych scharakteryzowanych pod względem różnego typu polimorfizmów genetycznych. I. Przedmiot zamówienia podzielono na 3 zadania: Zadanie 1: Weryfikacja danych, selekcja i grupowania informacji z zakresu systematyki i taksonomii molekularnej na tle danych dostępnych globalnie. Przedmiotem zamówienia jest weryfikacja i analiza danych genetycznych mikroorganizmów umieszczanych w bazie multigenbank. W ramach zamówienia wykonawca zweryfikuje sekwencje nukleotydowe o długości do 1600 nukleotydów w ilości 2700 z materiału dostarczonego przez zamawiającego. Wymagana jest jednokrotna weryfikacja z obydwu końców sekwencji. Efektem usługi powinno być uzyskanie danych o sekwencjach nukleotydowych. Zadanie 2: Zaawansowana analiza bioinformatyczna sekwencji/informacji o metabolitach bakteryjnych Przedmiotem zamówienia jest analiza działania i możliwości stosowania algorytmu wspomagającego projektowanie syntetycznych sekwencji nukleotydowych kodujących białka syntaz poliketydowych. Algorytm ma mieć zastosowanie w ukierunkowanym uzyskiwaniu metabolitów wtórnych metodami biologii syntetycznej. W ramach usługi ma być zweryfikowana miedzy innymi poprawność tworzenia sekwencji i zgodność struktury projektowanych związków ze strukturami uzyskiwanymi. W tym celu powinno zostać przeanalizowanych wiele różnorodnych przypadków funkcjonowania tego algorytmu. Zadanie 3: Kompleksowa analiza wykonana techniką mikromacierzy Przedmiotem zamówienia jest kompleksowa analiza profilu porównawczej hybrydyzacji genomowej (aCGH) dla 24 próbek DNA oraz wyznaczenie profilu ekspresji polimorficznych genów z wykorzystaniem 40 par próbek RNA (próbka referencyjna oraz próbka badana) pochodzących od 40 pacjentów z wykorzystaniem techniki mikromacierzy wraz z analizą i interpretacją wyników. Zamawiający dopuszcza składanie ofert częściowych na dowolną ilość zadań. Opis Przedmiotem zamówienia jest weryfikacja i analiza danych genetycznych mikroorganizmów umieszczanych w bazie multigenbank. W ramach zamówienia wykonawca zweryfikuje sekwencje nukleotydowe o długości do 1600 nukleotydów w ilości 2700 z materiału dostarczonego przez zamawiającego. Wymagana jest jednokrotna weryfikacja z obydwu końców sekwencji. Efektem usługi powinno być uzyskanie danych o sekwencjach nukleotydowych.Przedmiotem zamówienia jest analiza działania i możliwości stosowania algorytmu wspomagającego projektowanie syntetycznych sekwencji nukleotydowych kodujących białka syntaz poliketydowych. Algorytm ma mieć zastosowanie w ukierunkowanym uzyskiwaniu metabolitów wtórnych metodami biologii syntetycznej. W ramach usługi ma być zweryfikowana miedzy innymi poprawność tworzenia sekwencji i zgodność struktury projektowanych związków ze strukturami uzyskiwanymi. W tym celu powinno zostać przeanalizowanych wiele różnorodnych przypadków funkcjonowania tego algorytmu.Przedmiotem zamówienia jest kompleksowa analiza profilu porównawczej hybrydyzacji genomowej (aCGH) dla 24 próbek DNA oraz wyznaczenie profilu ekspresji polimorficznych genów z wykorzystaniem 40 par próbek RNA (próbka referencyjna oraz próbka badana) pochodzących od 40 pacjentów z wykorzystaniem techniki mikromacierzy wraz z analizą i interpretacją wyników.

Dodatkowe informacje

Biuletyn	1
Nazwa	Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polska Akademia Nauk
Ulica	ul. Rudolfa Weigla 12
Nr domu	12
Miejscowosc	Wrocław
Kod poczt	53-114
Wojewodztwo	dolnośląskie
Tel	71 3709997
Fax	71 3709997
Internet	www.iitd.pan.wroc.pl
Regon	00032588300000
E mail	zp@iitd.pan.wroc.pl
Czy obowiazkowa	Tak
Dotyczy	1
Rodzaj zam	Podmiot prawa publicznego
Rodz zam	U
Czy czesci	Tak
Ilosc czesci	3
Czy wariant	Nie
Czy dialog	Nie
Czy uzup	Nie
Czas	Obowiązuje termin
Czas dni	35
Wadium	Zamawiający określa kwotę wadium w wysokości: Zadanie 1: 1 000,00 złotych. Zadanie 2: 800,00 złotych. Zadanie 3: 2 000,00 złotych.
Zaliczka	Nie
Wiedza	Wykonawca spełnia warunek posiadania wiedzy i doświadczenia, jeżeli w okresie ostatnich 3 lat przed upływem terminu składania ofert, a jeżeli okres prowadzenia działalności jest krótszy - w tym okresie wykonał minimum: Zadanie 1: - min. 1 usługę polegającą na obsłudze jednostek naukowych w zakresie pozyskiwania i weryfikacji danych z sekwencji nukleotydowych, metodą Sangera. - posiada certyfikat europejskiej organizacji kontroli jakości potwierdzający prawidłowe wykonywanie techniki sekwencjonownia DNA wystawiony nie wcześniej niż 1 rok przed upływem terminu składania ofert. Zadanie 2: Zamawiający nie precyzuje szczegółowych wymagań Zadanie 3: min. 1 usługę w zakresie profilowania ekspresji genów i porównawczej hybrydyzacji genomowej na mikromacierzach oraz umiejętnością analiz bioinformatycznych otrzymanych wyników mikromacierzowych.
Potencjal	Wykonawca spełnia warunek dysponowania osobami zdolnymi do wykonania zamówienia, jeżeli przez cały okres realizacji zamówienia będzie dysponował: Zadanie 1: Dysponować sprzętem dającym możliwość jednoczesnej analizy co najmniej 90 próbek. Zadanie 2: Zamawiający nie precyzuje szczegółowych wymagań Zadanie 3: kompletną aparaturę do wykonania i analiz badań na mikromacierzach w tym: bioanalizator, skaner oraz pakiet profesjonalnego oprogramowania do analizy wyników.
Zdolne	Wykonawca spełnia warunek dysponowania osobami zdolnymi do wykonania zamówienia, jeżeli przez cały okres realizacji zamówienia będzie dysponował: Zadanie 1: Zamawiający nie precyzuje szczegółowych wymagań Zadanie 2: osobą zdolną do wykonania zamówienia posiadającymi kwalifikacje i doświadczenie zawodowe, w szczególności: - Będą posiadać wykształcenie wyższe biologiczne oraz co najmniej tytuł doktora z zakresu nauk biologicznych, udokumentowane co najmniej 3 letnie doświadczenie z zakresu bioinformatyki (min. 10 publikacji, w tym 5 z listy filadelfijskiej). - osobą posiadającą udokumentowaną wiedzę w zakresie: -genetyki mikroorganizmów, -analiz bioinformatycznych, -algorytmów analizy sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych np. Clustal, Blast, -budowy baz danych zawierających sekwencje nukleotydowe i aminokwasowe, -analiz statystycznych sekwencji nukleotydowych i aminokwasowych -biochemii metabolitów wtórnych Zamawiający dopuszcza wykazanie ww. doświadczenia przez jedną lub dwie osoby Zadanie 3: Zamawiający nie precyzuje szczegółowych wymagań
Oswiadczenie potwierdzenia 4	Tak
Oswiadczenie potwierdzenia 6	Tak
Oswiadczenie potwierdzenia 7	Tak
Oswiadczenie potwierdzenia 9	Tak
Oswiadczenia wykluczenia 1	Tak
Oswiadczenia wykluczenia 2	Tak
Oswiadczenia wykluczenia 3	Tak
Oswiadczenia wykluczenia 4	Tak
Oswiadczenia wykluczenia 8	Tak
Dok grup kap 1	Tak
Dok podm zag 1	Tak
Dok podm zag 2	Tak
Niepelnosprawne	Nie
Kod trybu	PN
Czy zmiana umowy	Tak
Zmiana umowy	1) nastąpią istotne zmiany przepisów lub norm mających zastosowanie do przedmiotu zamówienia; 2) nastąpią zmiany obowiązującej stawki VAT, ulec zmianie może cena w takim zakresie w jakim będzie to wynikało z przepisów; 3) zmiany terminu realizacji przedmiotu umowy ze względu na zmiany terminów w Projekcie. 4) w wypadku wystąpienia okoliczności, za które Wykonawca nie ponosi odpowiedzialności, skutkujących niemożnością dotrzymania przez niego terminu realizacji, określonego w umowie. Wówczas termin ten może ulec przedłużeniu, nie więcej jednak niż o czas trwania tych okoliczności. 5) w wypadku, gdy konieczne będzie wprowadzenie zmian dotyczących treści o charakterze in-formacyjnym lub instrukcyjnym, niezbędnym do realizacji Umowy, w szczególności zmian do-tyczących numeru rachunku bankowego Wykonawcy lub Zamawiającego, zmiany osób upoważnionych do komunikowania się, zmiany osób odpowiedzialnych za prawidłową realizację Umowy wraz z adresami, numerami telefonów, telefaksów, adresów poczty elektronicznej, itp.
Kryt cena	B
Kryt 1p	60
Kryt 2	Termin realizacji zamówienia
Kryt 2p	40
Spec www	www.iitd.pan.wroc.pl
Spec war	www.iitd.pan.wroc.pl
Data skl	13/10/2015
Godz skl	10:00
Miejsce	Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej im. Ludwika Hirszfelda Polska Akademia Nauk; ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław; pok. 152
Termin	Obowiązuje termin
Okres liczba dni	30
Inf dodat	Utworzenie bazy danych immunogenetycznych polskiej populacji MultiGenBank Nr POIG.02.03.02-02-028/13
Czy uniewaznienie	Nie